Требует подсистемы WSL (соответственно ТОЛЬКО Windows 10):

Enable-WindowsOptionalFeature -Online -FeatureName Microsoft-Windows-Subsystem-Linux

Требует ребут. Далее для папки включаем фичу (два варианта):

c:\someFolder> fsutil file setCaseSensitiveInfod:\folder enable d:\folder> fsutil file setCaseSensitiveInfo . enable

Включается для указанной папки и всех, ЧТО БУДУТ СОЗДАНЫ.

Для уже существующих рекурсивно не применяется. Можно вытащить вложеннные папки и положить обратно.

!! К папке профиля пользователя нельзя применять регистрозависимось. Только ко вложенным папкам. Не ко всему профлю.